Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms