Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms