Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms