Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms