Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms