Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcnaP17918 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms