Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra6P16305 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms