Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Irf1P15314 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Irf1P15314 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Irf1P15314 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf1P15314 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Irf1P15314 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Irf1P15314 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irf1P15314 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irf1P15314 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Irf1P15314 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf1P15314 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms