Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ApcsP12246 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms