Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms