Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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