Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp4O70480 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms