Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BckdkO55028 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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BckdkO55028 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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