Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FxnO35943 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms