Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm44749-201ENSMUST00000206285 1628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm12479-201ENSMUST00000120731 1585 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Olfr1120-201ENSMUST00000058737 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Lhx8O35652 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms