Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Clk2O35491 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Clk2O35491 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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Clk2O35491 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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