Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Prrt1O35449 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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