Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2O35245 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms