Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Casq1O09165 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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