Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema3aO08665 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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