Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MttpO08601 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MttpO08601 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms