Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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