Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp35M0QWN7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp35M0QWN7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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