Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm5108J3QP01 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm5108J3QP01 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5108J3QP01 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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