Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
E030018B13RikJ3QMS9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms