Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm3336J3QMQ6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3336J3QMQ6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3336J3QMQ6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3336J3QMQ6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3336J3QMQ6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3336J3QMQ6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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