Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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