Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms