Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21244J3QK38 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms