Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20830J3KML6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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