Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vmn1r58G3X9U3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms