Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M1F7CXU4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms