Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm8005F6YKY3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms