Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21974F6W3F3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1190.4 ms