Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Atf6F6VAN0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atf6F6VAN0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atf6F6VAN0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms