Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms