Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms