Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim12cD3Z3L3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms