Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms