Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5483B2RV77 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5483B2RV77 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms