Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apba1B2RUJ5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apba1B2RUJ5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms