Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf518aB2RRF6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf518aB2RRF6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms