Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H60cB1B213 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H60cB1B213 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
H60cB1B213 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms