Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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