Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atp8b5A3FIN4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atp8b5A3FIN4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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