Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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PtprfA2A8L5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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PtprfA2A8L5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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PtprfA2A8L5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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PtprfA2A8L5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtprfA2A8L5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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PtprfA2A8L5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprfA2A8L5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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