Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms