Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Top3bQ9Z321 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms