Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hdac6Q9Z2V5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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