Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms